Quando o Dr. Eggman mantém o presidente e sua filha como refém, Sonic deve cumprir a demanda do cientista do mal de ir para Eggmanland para parar Black Eggman e desativar o gerador da cidade antes que ele atinja a massa crítica. Mal sabe o Sonic que é uma armadilha para ativar o "Hyper Metal Sonic", um robô construído por Eggman para destruir o nosso herói.